Rクックブック

目次

はじめに

1章	入力と出力
    レシピ1.1　キーボードからデータを入力する
    レシピ1.2　出力する桁数を減らす（または増やす）
    レシピ1.3　出力をファイルにリダイレクトする
    レシピ1.4　ファイルの一覧を表示する
    レシピ1.5　Windowsの「ファイルが開けません」に対処する
    レシピ1.6　固定幅レコードを読み込む
    レシピ1.7　表形式データファイルを読み込む
    レシピ1.8　CSVファイルから読み込む
    レシピ1.9　CSVファイルに書き出す
    レシピ1.10　Webから表形式データまたはCSVデータを読み込む
    レシピ1.11　HTML表からデータを読み込む
    レシピ1.12　複雑な構造のファイルを読み込む
    レシピ1.13　MySQLデータベースから読み込む
    レシピ1.14　オブジェクトの保存や移動を行う

2章	データ構造
    レシピ2.1　ベクトルにデータを追加する
    レシピ2.2　ベクトルにデータを挿入する
    レシピ2.3　リサイクル規則を理解する
    レシピ2.4　ファクタ（カテゴリ変数）を作成する
    レシピ2.5　複数のベクトルを1つのベクトルとファクタに合成する
    レシピ2.6　リストを作成する
    レシピ2.7　リスト要素を位置を使って選択する
    レシピ2.8　リスト要素を名前で選択する
    レシピ2.9　名前/値の関連リストを作成する
    レシピ2.10　リストから要素を削除する
    レシピ2.11　リストをベクトルに変換する
    レシピ2.12　リストからNULL要素を削除する
    レシピ2.13　条件を使ってリスト要素を削除する
    レシピ2.14　行列を初期化する
    レシピ2.15　行列演算を行う
    レシピ2.16　行列の行と列に記述名を付ける
    レシピ2.17　行列から1行または1列を選択する
    レシピ2.18　列データでデータフレームを初期化する
    レシピ2.19　行データでデータフレームを初期化する
    レシピ2.20　データフレームに行を追加する
    レシピ2.21　データフレームを事前にアロケートする
    レシピ2.22　データフレームの列を位置を使って選択する
    レシピ2.23　データフレームの列を名前を使って選択する
    レシピ2.24　行と列をもっと簡単に選択する
    レシピ2.25　データフレームの列名を変更する
    レシピ2.26　データフレームを編集する
    レシピ2.27　データフレームからNA値を削除する
    レシピ2.28　名前で列を除外する
    レシピ2.29　2つのデータフレームを結合する
    レシピ2.30　共通列でデータフレームをマージする
    レシピ2.31　データフレームの内容にもっと簡単にアクセスする
    レシピ2.32　あるアトミック値を別のアトミック値に変換する
    レシピ2.33　ある構造化データ型を別の構造化データ型に変換する

3章	データ変換
    レシピ3.1　ベクトルをグループに分割する
    レシピ3.2　各リスト要素に関数を適用する
    レシピ3.3　すべての行に関数を適用する
    レシピ3.4　すべての列に関数を適用する
    レシピ3.5　データのグループに関数を適用する
    レシピ3.6　行のグループに関数を適用する
    レシピ3.7　並列ベクトルや並列リストに関数を適用する

4章	文字列と日付
    レシピ4.1　文字列の長さを取得する
    レシピ4.2　文字列を連結する
    レシピ4.3　部分文字列を抽出する
    レシピ4.4　区切り文字で文字列を分割する
    レシピ4.5　部分文字列を置換する
    レシピ4.6　文字列内の特殊文字を見る
    レシピ4.7　文字列の対となるすべての組合せを求める
    レシピ4.8　現在の日付を取得する
    レシピ4.9　文字列を日付に変換する
    レシピ4.10　日付を文字列に変換する
    レシピ4.11　年、月、日を日付に変換する
    レシピ4.12　ユリウス日を取得する
    レシピ4.13　日付の要素を抽出する
    レシピ4.14　日付の列を作成する

5章	確率
    レシピ5.1　組合せを数える
    レシピ5.2　組合せを求める
    レシピ5.3　乱数を生成する
    レシピ5.4　再現可能な乱数を生成する
    レシピ5.5　無作為標本を生成する
    レシピ5.6　乱数列を生成する
    レシピ5.7　ベクトルの順序をランダムに変える
    レシピ5.8　離散分布の確率を求める
    レシピ5.9　連続分布の確率を求める
    レシピ5.10　確率を分位数に変換する
    レシピ5.11　密度関数をプロットする

6章	一般統計学
    レシピ6.1　データを要約する
    レシピ6.2　相対度数を求める
    レシピ6.3　ファクタを表にして分割表を作成する
    レシピ6.4　カテゴリ変数の独立性を検定する
    レシピ6.5　データセットの分位数（および四分位数）を求める
    レシピ6.6　分位数を反転させる
    レシピ6.7　データをZ値に変換する
    レシピ6.8　標本の平均を検定する（t検定）
    レシピ6.9　平均値の信頼区間を求める
    レシピ6.10　中央値の信頼区間を求める
    レシピ6.11　標本比率を検定する
    レシピ6.12　比率の信頼区間を求める
    レシピ6.13　正規性を検定する
    レシピ6.14　連検定を行う
    レシピ6.15　2つの標本の平均を比較する
    レシピ6.16　2つの標本の位置をノンパラメトリックに比較する
    レシピ6.17　相関の有意性を検定する
    レシピ6.18　グループの比率が同じかどうかを検定する
    レシピ6.19　グループ平均の多重比較を行う
    レシピ6.20　2つの標本の分布が同じかどうかを検定する

7章	グラフィックス
    レシピ7.1　散布図を作成する
    レシピ7.2　タイトルとラベルを追加する
    レシピ7.3　グリッドを追加する
    レシピ7.4　複数グループの散布図を作成する
    レシピ7.5　凡例を追加する
    レシピ7.6　散布図の回帰直線をプロットする
    レシピ7.7　各変数と他のすべての変数の組合せをプロットする
    レシピ7.8　各ファクタ水準に対して1つの散布図を作成する
    レシピ7.9　棒グラフを作成する
    レシピ7.10　棒グラフに信頼区間を追加する
    レシピ7.11　棒グラフに色を付ける
    レシピ7.12　xとyの点から線を描画する
    レシピ7.13　線の種類、幅、色を変更する
    レシピ7.14　複数のデータセットを描画する
    レシピ7.15　垂直線や水平線を追加する
    レシピ7.16　箱ひげ図を作成する
    レシピ7.17　各ファクタ水準に1つの箱ひげ図を作成する
    レシピ7.18　ヒストグラムを作成する
    レシピ7.19　ヒストグラムに密度推定を追加する
    レシピ7.20　離散ヒストグラムを作成する
    レシピ7.21　正規Q-Qプロットを作成する
    レシピ7.22　その他のQ-Qプロットを作成する
    レシピ7.23　変数を複数の色でプロットする
    レシピ7.24　関数をグラフ化する
    レシピ7.25　プロットの間に一時停止する
    レシピ7.26　1ページに複数の図を表示する
    レシピ7.27　追加のグラフィックスウィンドウを開く
    レシピ7.28　プロットをファイルに書き出す
    レシピ7.29　グラフィックスのパラメータを変更する

8章	線形回帰とANOVA
    レシピ8.1　線形単回帰を実行する
    レシピ8.2　線形重回帰を実行する
    レシピ8.3　回帰統計量を取得する
    レシピ8.4　回帰要約を理解する
    レシピ8.5　切片なしで線形回帰を実行する
    レシピ8.6　交互作用項のある線形回帰を実行する
    レシピ8.7　最適な回帰変数を選ぶ
    レシピ8.8　データの部分集合に回帰を実行する
    レシピ8.9　回帰式の中で式を使う
    レシピ8.10　多項式回帰を行う
    レシピ8.11　変換データに回帰を実行する
    レシピ8.12　最適なべき変換を見つける（ボックス＝コックス法）
    レシピ8.13　回帰係数の信頼区間を求める
    レシピ8.14　回帰残差をプロットする
    レシピ8.15　線形回帰を診断する
    レシピ8.16　影響力の大きい観測値を見つける
    レシピ8.17　自己相関の残差を検定する（ダービン＝ワトソン検定）
    レシピ8.18　新しい値を予測する
    レシピ8.19　予測区間を求める
    レシピ8.20　一元配置分散分析を行う
    レシピ8.21　交互作用図を作成する
    レシピ8.22　グループ間の平均の差を求める
    レシピ8.23　頑健なANOVAを実行する（クラスカル＝ウォリス検定）
    レシピ8.24　ANOVAを使ってモデルを比較する

9章	便利なテクニック
    レシピ9.1　データの一部を見る
    レシピ9.2　出力の幅を広げる
    レシピ9.3　割り当ての結果を出力する
    レシピ9.4　行や列を合計する
    レシピ9.5　データを列で出力する
    レシピ9.6　データを分類する
    レシピ9.7　特定の値の位置を見つける
    レシピ9.8　ベクトルのn番目ごとの要素を選ぶ
    レシピ9.9　対の最小値や最大値を見つける
    レシピ9.10　複数のファクタのすべての組合せを求める
    レシピ9.11　データフレームを変換する
    レシピ9.12　データフレームをソートする
    レシピ9.13　2つの列でソートする
    レシピ9.14　変数から属性を取り除く
    レシピ9.15　オブジェクトの構造を明らかにする
    レシピ9.16　コードの時間を測る
    レシピ9.17　警告やエラーメッセージを隠す
    レシピ9.18　リストから関数引数を取り込む
    レシピ9.19　独自の二項演算子を定義する

10章	高度な数値計算と統計
    レシピ10.1　単一パラメータ関数の最小または最大を求める
    レシピ10.2　複数パラメータ関数の最小または最大を求める
    レシピ10.3　固有値と固有ベクトルを求める
    レシピ10.4　主成分分析を行う
    レシピ10.5　簡単な直交回帰を実行する
    レシピ10.6　データ内のクラスタを見つける
    レシピ10.7　二値変数を予測する（ロジスティック回帰）
    レシピ10.8　統計量にブートストラップを行う
    レシピ10.9　因子分析

11章	時系列分析
    レシピ11.1　時系列データを表す
    レシピ11.2　時系列データをプロットする
    レシピ11.3　最古または最新の観測値を抽出する
    レシピ11.4　時系列データの部分集合を作成する
    レシピ11.5　複数の時系列データをマージする
    レシピ11.6　時系列データの穴埋めや付け足しを行う
    レシピ11.7　時系列データの時間をずらす
    レシピ11.8　階差を求める
    レシピ11.9　時系列データの計算を行う
    レシピ11.10　移動平均を求める
    レシピ11.11　カレンダー期間で関数を適用する
    レシピ11.12　ローリング関数を適用する
    レシピ11.13　自己相関関数をプロットする
    レシピ11.14　時系列データの自己相関を検定する
    レシピ11.15　偏自己相関関数をプロットする
    レシピ11.16　2つの時系列データ間の遅れ相関を見つける
    レシピ11.17　時系列データのトレンドを除去する
    レシピ11.18　ARIMAモデルをフィットする
    レシピ11.19　有意でないARIMA係数を取り除く
    レシピ11.20　ARIMAモデルを診断する
    レシピ11.21　ARIMAモデルから予測する
    レシピ11.22　平均回帰を検定する
    レシピ11.23　時系列データを平滑化する

索引